Прежде всего, скачайте CommandFunc.txt.
Откройте его. Я покажу вам, как менять координаты иконок на примере иконки приказа "Атаковать".
Найдите строку:

[CmdAttack]
Art=CommandAttack
Buttonpos=3,0

Buttonpos - это те самые нужные нам координаты кнопки (х,у). Значения смотрите на рисунке ниже (первая цифра - Х, вторая - Y):

Выставляем координаты так, как мы хотим.
Я поставил их на 1,1.
Теперь импортируем этот текстовый документ и прописываем ему путь как на скриншоте:

В результате в игре получится такая вот кнопочка:

Для того, чтобы поменять описания и горячие клавиши, скачиваем файл CommandStrings.txt.
Я покажу вам манипуляции на примере приказа "Двигаться".

[CmdMove]
Tip=|cffffcc00M|rove
Ubertip="Orders your units to move to the target area, while ignoring enemy units and attacks. Issuing a move order onto a target unit will cause your unit to follow the target."
Hotkey=M

Меняем это так, как хотим. Импортируем и этот текстовый документ в карту под путём, указанным на скришоте:

У меня получилось вот так:

Ну, вот и всё. Просто, но со вкусом.